Новая ветка ядра Linux 2.8.

Как будет, так и будет. поживём увидим....
Но скорее всего всё пройдёт мягко. проблемы могут возникнуть если софт ставишь не из репозитория.

у меня в прошлый переход были только проблемы с драйвером видюхи от н-видии. тогда еще официальный в репозитории не поддерживал опенгл и приходилось ставить бинарники от нвидии, на новом ядре все весело слетело.

Машина времени поломалась, Пифия взяла отгул, и как оно будет на самом деле -- никто не знает. По опыту и воспоминаниям:
с 2.0 на 2.2: довольно-таки легко, в новом ядре включили ncpfs (новелловскую), тогда это было актуально, на старом ядре приходилось собирать ручками, а тут модуль уже в кармане.
с 2.2 на 2.4: чуть сложнее, пришлось изучать новый iptables вместо ipchains. 2.2 было последним ядром, которое я ещё собирал из исходников, понимая бОльшую часть вопросов из menuconfig. Ядро 2.4 резко расширила горизонты моего невежества, так что теперь я бесконечно доверяю сборщикам ядер своего дистрибутива.
с 2.4 на 2.6: легко и свободно. Почему-то даже переход на etcnet не вызвал сколько-нибудь значительных проблем, всё быстро нашлось и в большинстве случаев настроилось само. Постигать подробности стало сложнее, но интереснее. Я и не знал раньше, что процессоры могут быть plug'n'play и вводиться в строй и выводиться на лету. Оказывается, наше ядро так умеет!