"modx 1.4 проблема индексирования"

Насколько я знаю - это не проблема движка. Гугл намного быстрее "кушает" сайты. В то время появление в индексе Яндекса может занять больше месяца.

что бы роботам поисковых систем было проще находить и индексировать страницы сайта необходимо создать sitemap.xml (если его еще нет :) ). Создать файл можно с помощью этого ресурса http://www.xml-sitemaps.com/
Полученный sitemap.xml кидайте в корень сайта.

Яндекс действительно медленно индексирует сайты. Если через 2 недели главная страница появилась в поиске, то это нормально. Но для лучшей индексации нужно действительно создать файл sitemap.xml. Только никакие сервисы не нужны. Некоторые просто забыли, что разговор здесь идет про динамические сайты на cms, а не какие то там статичные странички. Специально, в частности, для MODx создан сниппет специальный, который сам генерирует карту sitemap.xml. Генерирует динамически, самостоятельно прописывая новые страницы. Самому ничего делать не надо. Нужно только этот сниппет установить и настроить и все. И конечно показать его поисковикам в Яндекс и Гугл инструментах вебмастера.
Для лучшей индексации Яндексом нужно также использовать человеко понятные URL в MODx и создать желательно еще обычную карту сайта (как новую веб-страницу).
И есть еще одно. MODx Evolution даже версия 1.0.5 генерирует дубликаты страниц. А это замедляет индексацию и не очень хорошо. Я недавно столкнулся с этой проблемой, но уже успешно ее решил. В течение этой недели напишу статью по этой теме на сайте Greenlight5.com. Этот сайт создан на  MODx Evolution 1.0.5.
Вообще же MODx одна из лучших cms в мире. В целом она реально SEO ориентирована.