Как вырезать иконку со свечением которое формируется из подложки?

Судя по всему использовались режимы наложения, от них надо избавляться, нужно сделать чтобы свечение не зависело от цвета подложки, просто это не сделать, нужно переводить эффекты в режим normal и попытаться сделать их выглядящими так же (ну почти), для этого придется изменить цвет и возможно иные параметры эффекта слоя.
В принципе не избавляясь от наложений можно попытаться растрировать эффекты (layer > layer style > create layer), после чего сделать выделение на их основе (ctrl+клик по иконке растрированного слоя с нужным эффектом на палитре слоев), получившимся выделением выдрать с подложки кусок по форме эффекта и соединить этот кусок с растрированным эффектом, который соединившись в наложении в один слой с куском подложки приобретёт свойство normal.
Оба варианта так себе. Нужно было изначально не допускать использования наложений при создании материала, который будет размещаться на рандомном бекграунде. Ну и вобще иконки в Photoshop делать не стоило, разве что для сайта они. Правда в последнем случае можно особо не париться, и если для верстки не критично просто слить все слои и вырезать иконки в виде квадратных фрагментов.