Каким методом лучше делать анимацию мимики

Нет. Обычно сейчас ее делают с помощью датчиков размещенных на лице человека, так как ты правильно сказал - другим способом это долго и сложно...

Я хоть и мало занимался персонажкой, но отвечу.
Если не искать плагины - то лучше морфингом. Естественно, до сглаживания, пока мало вершин. Буквально сейчас на чайниках и кубиках проверил — к заскиненой модели с морфингом для лица нормально добавляются новые morph target'ы в любом количестве (если конечно вы добавляете через pick object from scene, а не capture current state). Морфинг ведь работает в локальных координатах каждой вершины. И при этом все еще можно редактировать и скин и морфер.
Хотя для удобства можно сделать голову отдельно (для одетых персов — так сам бог велел делать отдельно). Это вообще избавляет от всех проблем. Туловище со скином, голова — с морфингом. Я бы так и делал.
____
Если все-таки искать плагины, вот в этой статье http://ac-reality.at.ua/load/8-1-0-84 чувак использует скрипт (раз скрипт - скорее всего бесплатный, я сам не пользовался) stretchi bones. Выглядит очень даже неплохо.