Навскидку самые распространённые причины тормозов современного компа:
1) Сидиром "свалился" в режим PIO (вместо DMA) и при работе тормозит всю систему (проверяется через свойства контроллера в диспетчере устройств). Решение: удалить IDE контроллер и перезагрузить систему дважды. И у вас вновь заработает DMA.
2) Вы установили резидентный антивирус. Решение: или привыкать к тормозам, или удалить антивирус. И больше никогда не устанавливать.
3) Вы подцепили вирус. Решение: проверить системный диск антивирусным сканнером, загрузившись в другую (заведомо чистую) ОС. Подойдёт загрузочный диск Hiren's boot CD + антивирусный сканнер CureIt:
http://freedrweb.ru
4) Вы установили несколько лицензионных игрушек от недобросовестных российских издателей (например 1С или Бука). Устанавливая такие игры вы сами заражаете компьютер вирусоподобной системой защиты StarForce. От неё не только тормозит система, но ещё и диски нормально не записываются.
О том, что у вас стоит эта гадость, вы можете узнать, запустив программу Autoruns и заглянув во вкладку Drivers:
http://technet.microsoft.com/en-us/sysinternals/bb963902.aspx
Решение: удалить StarForce при помощи Autoruns или специальной утилиты (гугл найдёт). Если версия СтарФорса новая, то он удалится при помощи файла Protect.exe, находящегося в папке с игрой (там есть опция удаления драйверов защиты). После этого очистить реестр при помощи CCleaner Portable и перезагрузиться!
Впредь не устанавливать лицензионные игрушки, для которых ещё не вышли патчи NoDVD (они позволяют запустить игру не устанавливая СтарФорс). Сами патчи искать например на:
http://antistarforce.com/
5) Вы установили какую-то программу (не обязательно вирус), которая влезла в автозапуск и совершает какие-то действия без вашего ведома. Набрать Пуск > Выполнить > Msconfig и внимательно изучить вкладку "автозагрузка". Там должен быть только Ctfmon.exe - индикатор раскладки клавиатуры.
6) Банальное "устаревание" винды. На сегодняшний день, windows - единственная ОС с ярко выраженным "эффектом старения". Смысл в том, что что бы вы ни делали, как бы ни чистили систему, ни содержание её системных папок, ни структура реестра (особенно она!) уже не возвращаются к изначальному состоянию. Это технически невозможно на винде.
Единственный выход - регулярные переустановки. В среднем 2 раза в год при активном использовании.