Как это нет разницы? Во-первых, надо, уточнить для каких целей, может человек хочет на них системные скрипты писать, в вопросе об этом ничего не сказано.
Вот покажи сначала как в php полноценно работать, например, со стандартными потоками, а потом уже и будешь говорить, что нет разницы
Я много пишу на PHP, сейчас даже работаю PHP-программистом. Но вот совсем недавно заинтересовался Питоном, приобрёл хорошую книгу по нему, начал изучать. И вот, что я Вам скажу: меня он сразу чем-то зацепил, показался очень лаконичным и выразительным, очень простым, но в то же время очень мощным языком. Всё в нём как-то логично и последовательно. Короче, очень понравился мне этот язык. И я думаю, что на перспективу лучше изучать именно его, потому что в наши дни PHP-программистов очень много, как недавно прочитал здесь - в "Ответах", даже школота его знает, и готовы писать на нём чуть ли не за еду, а толковых программистов на Питоне и Руби очень мало и компании вынуждены часто брать новичков. В принципе, так и есть. Так что он перспективнее. И ещё: после ознакомления с Питоном меня начало воротить от PHP, но приходится писать именно на нём, потому что на жизнь зарабатывать нужно. Я сейчас поставил себе цель: за несколько месяцев изучить Питон и попробовать перебраться на него. Потому что работа должна нравиться :-)
P.S. Что касается Perl, то я его плохо знаю, но PHP многое взял из него, да и исходники я пробовал на нём читать. Ужас. А за Питоном заметил ещё такую особенность: ещё почти не зная языка, пробежавшись лишь по нескольким статьям-обзорам по нему, у меня получалось читать тексты на нём, не точно их понимать, потому что там своя модель типов и свой особенный синтаксис, очень необычные после PHP, но сам алгоритм улавливал. А сейчас, познакомившись с этим языком лишь поверхностно, я уже более-менее нормально читаю тексты на нём. То есть программы на Питоне удивительно хорошо читаются, стоит только привыкнуть к его необычному для программиста на "сиподобных" языках синтаксису. А это означает, что их очень легко сопровождать. Это очень важно в больших проектах. Так что "думайте сами, решайте сами", но я Вам советую выбрать Питон. Я вот уже сделал свой выбор.
P.P.S. Ещё можно посмотреть в сторону Руби :-) Но лично у меня в приоритете именно Питон.